多次元のデータをみて、”効いている”ところを探す場合や発表資料の作成に効果がある、ggobiをOPENSOURCEの統計ソフト”R”で設定する場合のmemo。

OSXネイティブなR、GTK2フレームワークを用いてRのラッパー"rggobi"を使ってデータをぐりぐりして遊ぶことができるようにする解説である。

＊＊ なにが問題か？

ggobiのHPによれば、これはUNIX系のソフトの掟でLeopardで使用する場合、つぎのモノが必要である。

• ggobi
  • 必要なFRAMEWORK
    
    • gtk（HPのlinkから落とせる）
  • Rのパッケージ
    
    • rggobi（HPのlinkから落とせる）

ところがこれだけではRのパッケージ導入コマンドではエラーが発生する。rggobiを導入する時にコンパイルエラーが発生するからだ。

＊＊ 何が必要か？

ggobiはgtk2のframeworkを必要とする。１）Macportで導入する場合、２）OSXのDISKIMAGEから
導入する方法がある。前者は豊富なオプションが選べるし、他のUNIX系ソフトと共存させうる。

しかし、OSX用のggobiはそこで紹介するgtk2パッケージを決めうちで必要とするようである。

外観を両者で試したら、フォントの見栄えは後者の方が若干綺麗だった。

NextStepの流れを汲むOSXの精神を尊重？し後者のOSXのFrameworkを用い、かつRもOSXのFrameworkを用いる方針にする。RもMacportで導入できるが、私のような素人親父では管理仕切れないと判断。

＊＊ どう解決するか？

具体的には、環境変数$PKG_CONFIG_PATH を適切に設定し、そこに保存されたOSXネイティブなGTK2のhoge.pcを探し出して、PKG_CONFIG_PATHにコピーする。

＊＊＊ pkg-config

pkg-configはUNIX系でここ数年多用される傾向にある。コンパイルに必要なLIB等の情報の提供を統一化するためにある。たとえば最近のconfigureは必要な情報をpkg-configが与えてくれることを期待している。これによりコンパイルの確実性が増すモノであると聞く。

これはこういうことをやるヒトはMAC PORTS で導入して|されているだろうが、このpkg-configに必要な設定情報が記載されているhoge.pcをあるDIRに集中保存して、ConfigureやRのinstall.packageコマンドが理解するようにすれば良い。

AT&TのページでDownloadしたOSX用のDISKIMAGEには記載されていない？がGgobiを導入するとOSXの”/usr/local/ggobi/lib/pkgconfig”に必要な.pcがある。これをMACPortで入れたpkg-configPKG_CONFIG_PATHに管理者モードでコピーする

”sudo cp ggobi.pc /opt/local/lib/pkgconfig"

 

するとR上のinstall.package("rggobi")にてコンパイルが成功する。その後、本家や同志社大学・金（JIN）先生のページを拝見するなどして活用する。（ありがたい。AT&TとProf.Jinに感謝する）
 
＊ Macportで導入させたい場合

ggobi-documentation

的確な情報がこちらに記載されており、必要なものを入れればよい（とおもう）。

私は会社でDebian上のRを使用している。OSXのものは綺麗ではあるが、管理上の便利さ・環境整備という意味ではDebianのほうが上だと感じる。

以上